Der gemeinsame Begleitausschuss besteht aus Vertretern der wichtigsten österreichischen und slowakischen Akteure der Grenzregion. Öffentliche Stellen, sowie die Sektoren Arbeitsmarkt und NRO sind im Begleitausschuss vertreten. Die Verwaltungsbehörde hat den Vorsitz. Im Begleitausschuss wird das Antragsformular genehmigt, die Auswahl über zu fördernde Projekte getroffen, über Projektänderungen entschieden, usw.
Die Liste der Mitglieder des Begleitausschusses für die Periode 2014-2020 finden Sie hier:
| Inštituácia/Institution | Člen Monitorovacieho výboru/Mitglied des Begleitausschuss | Zástupca člena Monitorovacieho výboru/Vertretung des Mitgliedes des Begleitausschuss |
| Riadiaci orgán - MPRV (predsedníctvo MV) | Mgr. Katarína Mihaľová | Mgr. Monika Csonková, PhD. |
| Ministerstvo pôdohospodárstva a rozvoja vidieka SR | Ing. Marek Mitošinka | PhDr. Emil Pícha, CSc. |
| Mesto Bratislava | RNDr. Želmíra Greifová | Mgr. Ján Slimák |
| Bratislavský samosprávny kraj | Mgr. Barbora Lukáčová | Ing. Michal Beniač |
| Ministerstvo životného prostredia SR | PhDr. Miroslava Hrušková, CSc. | Ing. Jana Rolínová |
| Trnavský samosprávny kraj | Pavol Kalman | Ing. Ida Antipovová |
| CKO - Úrad vlády | Eva Ruppová | Ing. Gabriela Izáková |
| Orgán Auditu -Ministerstvo financií SR | Ing. Alena Vidová | Ing. Zuzana Ruppeldová |
| ZMOS | Ing. Paulína Polonyová | Mgr. Branislav Grimm |
| Ministerstvo financií SR | Mgr. Marcela Zubriczká | Ing. Antónia Mayerová |
| Regionalmanagement Burgenland | Dr. Harald Ladich | Mag. Harald Horvath |
| Amt der Niederösterreichischen Landesregierung | Mag. François-Edouard Pailleron | Hajnalka Triteos Meidlik |
| NÖ Regional GmbH | DI Doris Fried | Ing. Alena Hosch |
| Magistrat der Stadt Wien | Mag. Petra Wallner | Mag. Adriana Bachora-Nowak |
| Bundesministerium für Wissenschaft, Forschung und Wirtschaft | Dr. Klaus Höglinger | Sonja Goetz |
| Bundesministerium für Bildung, Wissenschaft und Forschung | Dr. Petra Hiermann-Fochta | Mag. Armin Mahr |
| Bundesministerium für Nachhaltigkeit und Tourismus | Ing. DI Martin Nöbauer | Mag. Dr. Catrin Promper |
| Bundeskanzleramt | Mag. Alexandra Deimel | Manfred Bruckmoser |
| Bundesministerium für Arbeit, Soziales, Gesundheit und Konsumentenschutz | Mag. Roland Hanak | Enisa Kurpejovic |
| Österreichische Botschaft | Mag. Georg Kilzer | Dr. Simon Gruber |
| Umweltdachverband | Mag. Gerald Pfiffinger | Mathilde Stallegger, MSc. |